国防教育基地是泉州海洋职业学院最具特色的二级学院之一，学院开设国防后备班，共有航海技术、轮机工程技术、电子信息工程技术、计算机应用技术四个专业，这四个专业是中国人民解放军士官直招重点招收专业。国防后备班目标是培养拥护中国共产党领导，拥护中国特色社会主义制度，德、智、体、美、劳全面发展的国防后备人才，专业培养胜任航海技术、轮机工程技术、电子信息工程技术、计算机应用技术等专业相应岗位工作需要，达到大学专科文化程度的高素质技术应用型国防后备人才。

学院招收立志投身军营、品学兼优、身体达标的学生，在校期间学习专业课程，参与军事训练，实行军事化管理，修完专业规定的学分。毕业当年，参加体检、政审双合格后经兵役机关确定进入部队直招士官或义务兵服役，享受国家资助政策。

近年来，学校已为军队输送了526名军政素质过硬的大学生，其中有131名优秀毕业生被海军、陆军、武警等直招为现役士官，2015-2022年连续七年直招士官人数均超过泉州市高校的50%。